Ja też miałem problem z migającym/zanikającym menu. Przyczyna była co najmniej dziwna - obecność okien innych aplikacji pod Gmaksem. Ale nie wszystkich. Jednym z "psujących" było okno przeglądarki z Youtubem. Jeśli miałem odpalony Youtube w Chrome, a następnie przeszedłem do Gmaksa z paska zadań, to menu migało lub się nie pojawiało. Jeśli zaś najpierw zminimalizowałem okno Chrome, a dopiero później zmaksymalizowałem okno Gmaksa - wszystko było ok. Najlepiej spróbuj używać Gmaksa bez odpalonych jakichkolwiek innych aplikacji. Aczkolwiek kompletnie nie rozumiem, z czego to wynika...