A czemu nie możesz zapisywać w BMP? Pliki DDS są po to, żeby paczka była mniejsza i żeby po rozpakowaniu zajmowała mniej miejsca na dysku. Jeśli robisz modyfikacje na własny użytek, to format tekstury jest mało istotny.
W zasadzie, to tam jest przezroczystość, więc BMP się nie nadaje, lepiej TGA.